Le Comité International du Forum, présidé par Prof. Benedito Braga, rassemble le Conseil Mondial de l’Eau et le Comité National Français, qui lui-même rassemble les acteurs français : Etat et ses établissements publics, Ville de Marseille, Communauté Urbaine Marseille-Provence-Métropole, Conseil Général des Bouches du Rhône, Conseil Régional Provence-Alpes-Côte d’Azur, partenaires publics et privés.
Un Bureau de 4 personnes est composé pour moitié de membres du conseil d’administration du Conseil Mondial de l’Eau – Prof. Benedito Braga et Guy Fradin – et pour moitié de membres du conseil d’administration du Comité National Français – Martine Vassal et András Szöllösi-Nagy.
L’organe exécutif de préparation et d’organisation du forum est le Secrétariat du Forum. Il rassemble 26 personnes au service des 4 processus préparatoires, du programme du 6ème Forum Mondial de l’Eau, et des parties prenantes concernées.